JdS2012


 English   -  Français  

Résumé de communication



Résumé 179 :

Inférence conjointe de réseaux de gènes dans de multiples états
Jung, Nicolas ; Maumy-Bertrand, Myriam ; Vallat, Laurent ; Bertrand, Frédéric
Faculté de Médecine Strasbourg

Quand une cellule est stimulée, le programme génique qu'elle contient est activé. Les gènes mis en action apportent alors une réponse concertée au stimulus. Cette réponse est modélisée statistiquement par un réseau dans lequel les noeuds correspondent aux gènes et les liens correspondent à leurs interactions. A partir des expressions de ces gènes, un nombre important de méthodes statistiques a été proposé pour inférer les réseaux de gènes sous-jacents. Certaines maladies, comme le cancer par exemple, affectent le programme génique. Pour tenter de comprendre les perturbations qui en résultent, il est nécessaire d'estimer le réseau de gènes dans les différents états (sain/malade, par exemple). En supposant que seule une partie restreinte du réseau est affectée par la maladie, une estimation simultanée des différents réseaux (correspondant chacun à un état particulier) est nécessaire. Cette estimation simultanée permet d'une part d'utiliser pleinement l'information commune dans les sous-parties du réseau inchangées d'un état à l'autre, et d'autre part, d'obtenir des réseaux plus facilement comparables. La méthode que nous proposons s'inscrit dans ce cadre.